電磁流量計在使用的時候會產生很多的誤差，出現很多的問題。會嚴重的影響測試的效果分析。最常見的問題就是非軸對稱流動引起的誤差：流體在管內流速為軸對稱分布時，他們都在均勻磁場中，在流量計的電極上所產生的電動勢的大小與所測的流體的流速分是沒有關系的，同時與流體的平均流速成正比，但是當非軸對稱流速分布時，即是每個流動質點相對于電極幾何位置的不同，對電極所產生的感應電動勢的大小也不同，愈靠近電極，速度大的質點所產生的感應電動勢越大。所以，在測試的時候必須保證流體流速為軸對稱。沒有注意如管內流速為非軸對稱分布就會引起誤差。因而在選裝電磁流量計時要盡可能保證直管段的要求以減小其所引起的誤差。   

      管內液體未充滿  由于背壓不足或流量傳感器安裝位置不良，致使其測量管內液體未能充滿，故障現象因不充滿程度和流動狀況有不同表現。若少量氣體在水管管道中呈分層流或波狀流，故障現象表現為誤差增加，即流量測量值與實際值不符；若流動是氣泡流或塞狀流，故障現象除測量值與實際值不符外，還會因氣相瞬間遮蓋電極表面而出現輸出晃動；若水平管道分層流動中流通截面積氣相部分增大，即液體未滿管程度增大，也會出現輸出晃動，若液體未滿管情況較嚴重，以致液面在電極以下，則會出現輸出超滿度現象。   

      液體中含有固相  液體中含有粉狀、顆粒或纖維等固體，可能產生的故障有；①漿液噪聲；②電極表面玷污；③導電沉積層或絕緣沉積層覆蓋電極或襯里；④襯里被磨損或被沉積物覆蓋，流通截面積縮小。 

      有可能結晶的液體，電磁流量計應慎用  有些易結晶化工物料在溫度正常的情況下能正常測量，由于輸送流體的導管都有良好的伴熱保溫，在保溫工作時不會結晶，但是電磁流量傳感器的測量管難以實施伴熱保溫，因此，流體流過測量管時易因降溫而引起內壁結上一層固體。由于改用其他原理的流量計測量也同樣存在結晶問題，所以在無其他更好方法的情況下，可選用測量管長度非常短的一種“環形”（oring）電磁流量傳感器，并將流量計的上游管道伴熱保溫予以強化。在管道連接方法上，考慮流量傳感器拆裝方便，在一旦結晶時能方便地拆下維護 

      電極和接地環材質選擇不當引發的問題  因材質與被測介質不匹配而引發故障的電磁流量計與介質接觸的零部件有電極與接地環，匹配失當除耐腐蝕問題外，只要是電極表面效應。表面效應應有：①化學反應（表面形成鈍話膜等）；②電化學和極化現象（產生電勢）；③觸媒作用（電極表面生成氣霧等）。接地環也有這些效應，但影響程度要小一些。